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Galaxy API测试

项目描述

https://badge.fury.io/py/galaxy-test-api.svg

概述

The Galaxy API测试。

历史

24.1.2 (2024-09-25)

错误修复

  • 防止提交工作,如果输入收集元素被@mvdbeek#18517中删除

  • 通过@davelopez修复Job索引API中的视图参数类型,在#18521

  • 通过@mvdbeek修复运行时输入的map over计算,在#18535

  • 通过@arash77修复归档头编码,在#18583

  • 通过@mvdbeek防止将文件大小设置为0,在#18653

  • 通过@mvdbeek修复从历史记录中提取工作流,当隐式收集没有作业时,在#18661

  • 通过@mvdbeek修复表达式工具数据输出上的PJA数据类型更改,在#18691

  • 通过@mvdbeek修复与数据输入连接的延迟子工作流步骤的子工作流调度,在#18731

  • 通过@mvdbeek捕获并显示导入格式不正确的yaml工作流时的异常,在#18734

  • 通过@mvdbeek修复如果跳过的步骤创建HDCA则无限延迟的工作流调度,在#18751

  • 通过@mvdbeek修复复制包含子工作流步骤的工作流,在#18802

  • 通过@mvdbeek在重运行问题上引发MessageException而不是断言,在#18858

  • 通过@mvdbeek修复data_column引用嵌套集合,在#18875

24.1.1 (2024-07-02)

错误修复

增强

24.0.3 (2024-06-28)

错误修复

24.0.2 (2024-05-07)

错误修复

  • @mvdbeek#18078中改进“提取数据集”工具的错误信息

24.0.1 (2024-05-02)

错误修复

  • @mvdbeek#17858中修复编辑器中的工具版本切换问题

  • @mvdbeek#17869中修复工作流程运行表在某些历史记录上失败的问题

  • @mvdbeek#17890中始终在列出内容时序列化element_count和populated

  • @mvdbeek#17892中使wait_for_history_jobs查看作业而不是数据集

  • @mvdbeek#17952中修复映射作业的隐式转换丢失问题

  • @mvdbeek#17976中修复压缩文本数据类型的get_content_as_text

  • @mvdbeek#18023中如果用户强制收集未填充元素作为输入时,则引发适当的异常

  • @mvdbeek#18026中修复test_get_tags_histories_content测试

  • @mvdbeek#18044中确保偏移量和限制永远不会是负数

  • @davelopez#18068中修复批量操作后的历史记录更新时间

24.0.0 (2024-04-02)

错误修复

  • @ahmedhamidawan#17444中仅在/api/{history_dataset_collection_id}/contents/{dataset_collection_id}中检查访问权限

  • @nsoranzo#17547中修复test_index_advanced_filter API测试重新运行

  • @mvdbeek#17657中限制新的匿名历史记录

  • @mvdbeek#17716中修复StoredWorkflowDetailed模型的步骤类型序列化

  • @davelopez#17726中修复历史记录API索引查询序列化

  • @jmchilton#17728中修复导入公共历史记录时更新_time的问题

  • @mvdbeek#17777中在完成作业时设置作业输出的副本的扩展名和元数据

  • @mvdbeek#17803中修复动态集合的change_datatype PJA

  • @davelopez#17856 中修复了归档历史记录与活动历史记录在列表中混淆的问题。

增强

23.2.1 (2024-02-21)

错误修复

  • 修复:通过API直接序列化 tool_shed_urls。由 @davelopez#16561 中提出。

  • @ahmedhamidawan#16872 中恢复ToolsApi并创建新的面板结构API路由。

  • @nsoranzo#16884 中进行Ruff和flake8修复。

  • @nsoranzo#17144 中使create tag API的payload再次可选。

  • 仅检查/api/{history_dataset_collection_id}/contents/{dataset_collection_id}的访问权限,由@mvdbeek#17459中提出。

增强

  • 实现数据和集合参数的默认位置。由@jmchilton#14955中提出。

  • 在取消调用时删除非终端作业和子工作流程调用,由@mvdbeek#16252中提出。

  • 将用户API的一部分迁移到Fast API,由@heisner-tillman#16341中提出。

  • 重构工具面板视图结构,并将ToolBox和ToolBoxWorkflow合并为一个组件,由@ahmedhamidawan#16739中提出。

  • test_dataset_collection_hide_originals中不要复制集合元素,由@nsoranzo#16747中提出。

  • 删除遗留的服务器端搜索,由@jdavcs#16755中提出。

  • 将作业API的一部分迁移到Fast API,由@heisner-tillman#16778中提出。

  • 使用Vueify可视化网格,由@guerler#16892中提出。

  • api/tool_panel改为api/tool_panels/…,由@ahmedhamidawan#16928中提出。

  • 在保存工作流程时要求命名,默认为“未命名工作流程”,由@ahmedhamidawan#17038中提出。

  • 将ItemTags API迁移到FastAPI,由@arash77#17064中提出。

其他更改

23.1.4 (2024-01-04)

错误修复

23.1.3 (2023-12-01)

自上次发布以来没有记录的更改

23.1.2 (2023-11-29)

错误修复

  • __MERGE_COLLECTION__工具中跳过状态过滤,由@mvdbeek#16937中提出。

  • 修复工具面板视图部分复制中的重复工具,由@jmchilton#17036中提出。

增强

23.1.1 (2023-10-23)

错误修复

增强

23.0.6 (2023-10-23)

自上次发布以来没有记录的更改

23.0.5 (2023-07-29)

自上次发布以来没有记录的更改

23.0.4 (2023-06-30)

自上次发布以来没有记录的更改

23.0.3 (2023-06-26)

自上次发布以来没有记录的更改

23.0.2 (2023-06-13)

自上次发布以来没有记录的更改

23.0.1 (2023-06-08)

错误修复

  • @mvdbeek在作业参数组件中显示DCE,允许带有DCE输入的重运行,详情见#15744

  • @mvdbeek修复通过文件浏览器列出文件夹,详情见#15950

  • @davelopez修复历史中按名称过滤时的大小写敏感,详情见#16036

  • @mvdbeek修复dataype_change未更新HDCA更新时间,详情见#16099

  • @mvdbeek从代码文件validate_input钩子中提取HDA,详情见#16120

增强

  • 通过@hexylena#15684中添加了通过教程模式启动工作流的支持。

  • 允许在测试接口中设置auto_decompress属性,由@mvdbeek#16014中实现。

20.9.0 (2020-10-15)

  • 在Galaxy 20.09分支中从开发分支进行初始导入。

项目详情


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