Galaxy项目序列处理工具。
项目描述
Galaxy序列_utils
Galaxy的序列工具是一组用于读取、分析和转换序列格式的Python模块。
此包通过PyPI和bioconda分发。
Galaxy工具可以通过添加对galaxy_sequence_utils的需求来使用它。
历史记录
1.1.5 (2020-02-18)
修复fastqreader文件处理和CI测试 Pull Request 27
1.1.4 (2020-02-07)
放弃对Python < 3.5的支持 Pull Request 24，Pull Request 25
防止StopIteration引发RuntimeError Pull Request 20
添加fastqReader测试+测试数据；重构；修改 Pull Request 22
修复fastq_groomer的不一致标识符选项 Pull Request 23
1.1.3 (2018-07-06)
处理fastaWriter和fastqWriter中的默认格式=None问题 Pull Request 16
1.1.2 (2017-10-05)
在fastqNamedReader类中不要两次打开压缩文件 Pull Request 15
1.1.1 (2017-09-19)
修复fastq_filter.py、fastq_masker_by_quality.py、fastq_stats.py和fastq_to_fasta.py包装脚本 Pull Request 14
修复fastq_filter.py包装脚本 Pull Request 13
1.1.0 (2017-02-13)
支持gz和bzip2压缩文件。 Pull Request 11
将Galaxy工具的包装脚本移动到本项目，并在setup.py中安装。 Pull Request 11
1.0.2 (2017-02-02)
将common galaxyproject模板应用到Python结构。 5e9bfc0
感谢@nsoranzo，合并了PEP-8和Python 3修复。 Pull Request 4
实现项目测试。 a9b907c
首次发布到PyPI。
1.0.1 (2015-12-10)
允许fastqJoiner接受用于连接对之间的字符串。 Pull Request 2
1.0.0 (2015-10-30)
从Galaxy中提取初始导入，以构建工具存储中工具的独立依赖项。
使用setuptools Pull Request 1
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源分发
构建分发
哈希 for galaxy_sequence_utils-1.1.5-py2.py3-none-any.whl
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | f46e9ccec9313b7f1d5566acec85ac9b2b940f2bed468576cc837d186d608bdc |
|
| MD5 | 36dac3db2b7ec77249bd967704fa8271 |
|
| BLAKE2b-256 | 5dbb57457a4bf16c775f086269e77014b6ca6bb1295581c5fbfd8ee0638be475 |
