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Galaxy作业执行运行时工具

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项目描述

https://badge.fury.io/py/galaxy-job-execution.svg

概述

The Galaxy job execution runtime module.

代码: https://github.com/galaxyproject/galaxy

历史

24.1.2 (2024-09-25)

错误修复

如果容器监控POST失败，则重试（不要假设它已成功）由@natefoo在#18863

24.1.1 (2024-07-02)

错误修复

通过 @mvdbeek 在 #18462 中将额外输入文件添加到 get_input_fnames

增强功能

通过 @nsoranzo 在 #17991 中启用 warn_unused_ignores mypy 选项
通过 @mvdbeek 在 #18003 中将 galaxy 添加到用户代理
通过 @jmchilton 在 #18049 中重构 galaxy.files 插件加载 + 配置处理
通过 @davelopez 在 #18050 中在文件源中添加更强的类型注解并进行重构
通过 @galaxybot 在 #18063 中更新 Python 依赖项

24.0.3 (2024-06-28)

错误修复

通过 @mvdbeek 在 #18122 中在记录电子邮件 PJA 异常时包含跟踪信息
通过 @mvdbeek 在 #18131 中不要在 DeleteIntermediatesAction 中提交
通过 @mvdbeek 在 #18179 中如果只有额外输出文件目录则不要失败元数据
通过 @mvdbeek 在 #18231 中不要为错误作业设置数据集预览
通过 @mvdbeek 在 #18342 中不要将清除的输出复制到对象存储

24.0.2 (2024-05-07)

自上次发布以来没有记录的更改

24.0.1 (2024-05-02)

自上次发布以来没有记录的更改

24.0.0 (2024-04-02)

错误修复

通过 @bernt-matthias 在 #17266 中修复输出发现问题
通过 @mvdbeek 在 #17803 中修复 change_datatype PJA 以支持动态集合

增强功能

通过 @mr-c 在 #16954 中将最小 Python 版本更改为 3.8
通过 @bernt-matthias 在 #17016 中扩展 stdio 正则表达式匹配中的正则表达式组
通过 @nsoranzo 在 #17391 中更新到 black 2024 稳定样式

23.2.1 (2024-02-21)

增强功能

通过 @SergeyYakubov 在 #16783 中用 get_file_name 函数替换 file_name 属性
通过 @nsoranzo 在 #16915 中在 ruff 中启用一些 flake8-logging-format 规则
通过 @mvdbeek 在 #16955 中移动和重用 persist_extra_files
通过 @SergeyYakubov 在 #17025 中优化对象存储缓存操作

23.1.4 (2024-01-04)

自上次发布以来没有记录的更改

23.1.3 (2023-12-01)

自上次发布以来没有记录的更改

23.1.2 (2023-11-29)

错误修复

通过 @davelopez 在 #16919 中修复从路径链接文件导入库的问题
通过 @mvdbeek 在 #16965 中不要在 JobIO 实例属性中存储作业
通过 @mvdbeek 在 #17067 中修复使用 store_by="id" 和 outputs_to_working_directory 时额外文件集合的问题

23.1.1 (2023-10-23)

错误修复

通过 @davelopez 在 #16339 中修复标签所有权问题
通过 @mvdbeek 在 #16667 中即使 set_meta 失败也要推送到对象存储
通过 @mvdbeek 在 #16678 中修复在扩展元数据和 outputs_to_working_directory 模式中的元数据设置
通过 @mvdbeek 在 #16773 中修复了标签移除时的 ItemOwnerShipException 问题。
通过 @mvdbeek 在 #16855 中修复并防止了文件大小为 null 的持久化。

增强功能

通过 @jmchilton 在 #14073 中赋予用户选择存储目标的能力。
向 SQLAlchemy 2.0 发展：由 @jdavcs 在 #15421 中移除了 session autocommit 设置。
通过 @nuwang 在 #15497 中统一了文件源处理和 URL 处理。
按照架构描述，由 @jdavcs 在 #15557 中一致地处理了“email_from”配置选项。
通过 @mvdbeek 在 #15978 中按完整参数路径记录输入数据集和集合。
通过 @nsoranzo 在 #16035 中进行了 ruff 和 pyupgrade 的代码清理。
通过 @jmchilton 在 #16110 中改进了对象存储的缓存监控。
通过 @mvdbeek 在 #16199 中移除了各种回退行为。

23.0.6 (2023-10-23)

错误修复

通过 @mvdbeek 在 #16541 中修复了额外文件路径处理。
确保 job_wrapper 使用一致的元数据策略，由 @mvdbeek 在 #16569 中实现。
通过 @mvdbeek 在 #16595 中修复了额外文件处理和缓存对象存储的问题。

23.0.5 (2023-07-29)

自上次发布以来没有记录的更改

23.0.4 (2023-06-30)

自上次发布以来没有记录的更改

23.0.3 (2023-06-26)

自上次发布以来没有记录的更改

23.0.2 (2023-06-13)

自上次发布以来没有记录的更改

23.0.1 (2023-06-08)

自上次发布以来没有记录的更改

20.9.0 (2020-10-15)

来自 Galaxy 20.09 分支的第一个发布版本。

20.5.0 (2020-07-04)

来自 Galaxy 20.05 分支的第一个发布版本。

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此版本

24.1.2

2024年9月25日

24.1.1

2024年7月3日

24.0.3

2024年6月28日

24.0.2

2024年5月7日

24.0.1

2024年5月2日

24.0.0

2024年4月3日

23.2.1

2024年2月22日

23.1.4

2024年1月4日

23.1.3

2023年12月1日

23.1.2

2023年11月29日

23.1.1

2023年10月23日

23.1.dev0 预发布

2024年2月12日

23.0.6

2023年10月23日

23.0.5

2023年7月30日

23.0.4

2023年6月30日

23.0.3

2023年6月26日

23.0.2

2023年6月13日

23.0.1

2023年6月8日

22.1.1

2022年8月22日

21.9.0

2021年11月2日

20.9.0

2020年10月15日

20.5.0

2020年7月4日

19.9.0.dev0 预发布

2019年6月10日

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源分布

galaxy_job_execution-24.1.2.tar.gz (41.0 kB 查看哈希值)

上传时间 2024年9月25日 源

构建分布

galaxy_job_execution-24.1.2-py3-none-any.whl (42.9 kB 查看哈希值)

上传时间 2024年9月25日 Python 3

galaxy_job_execution-24.1.2.tar.gz 的哈希值

galaxy_job_execution-24.1.2.tar.gz 的哈希值
算法	哈希摘要
SHA256	`4512a0ab2e1ff730db12daf15d7a0609a59484de2b42b23cbfd75208ae4c680b`
MD5	`8f24ecaa0fedcf36202c6df1260fa26b`
BLAKE2b-256	`906dbdce8501430b7c207f757f79f4ad473cf8dc898d118c50e77d7f580f5f2f`

galaxy_job_execution-24.1.2-py3-none-any.whl 的哈希值

galaxy_job_execution-24.1.2-py3-none-any.whl 的哈希值
算法	哈希摘要
SHA256	`87148215783d7e4a5c00f0b372c1b17c0e6390c546e261c82a78a57caa13f498`
MD5	`0283a405a1c07b12d514c26a56fec1c2`
BLAKE2b-256	`b67ea4549cfccd1e59ff36dd8ede9d74d016f7500d24775a69352548943aad1b`

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24.1.2 (2024-09-25)

24.1.1 (2024-07-02)

错误修复

增强功能

24.0.3 (2024-06-28)

24.0.2 (2024-05-07)

24.0.1 (2024-05-02)

24.0.0 (2024-04-02)

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23.2.1 (2024-02-21)

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23.1.1 (2023-10-23)

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23.0.5 (2023-07-29)

23.0.4 (2023-06-30)

23.0.3 (2023-06-26)

23.0.2 (2023-06-13)

23.0.1 (2023-06-08)

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