ftrixminer 1.3.2

安装

pip install ftrixminer

ftrixminer --version

ftrixminer.cli --about

rsync

../kbp43231_scripts/myrsync.py dls-bxflow

旧信息

公式化管道代码在此处

/dls/science/groups/i04-1/software/luigi_pipeline/imager_pipe

这是以下链接的工作目录

https://github.com/xchem/formulatrix_pipe

公式化管道将图像放在这里

/dls/science/groups/i04-1/software/luigi_pipeline/imager_pipe/SubwellImages/9b5j_2023-03-23_RI1000-0276-3drop

这有什么有用的吗？

https://gitlab.diamond.ac.uk/cnp64921/dlsformulatrix.uploader/-/blob/master/formulatrix_uploader.py

至于luigi相关的内容，/dls/science/groups/i04-1/software/luigi_pipeline/imager_pipe/中的一个脚本会在从Formulatrix的SQL服务器提取信息后创建文件名。我认为9b5j部分是条形码，但您可能需要深入研究那里的脚本以了解其背后的逻辑。

顺便说一句，如果您想从Windows访问FOrmulatrix /Rockmaker，您可以通过浏览到访问RockMaker Imager \cs04r-nas01-02rockimager

您可以看到：\cs04r-nas01-02rockimagerrockimagerRockMakerStorageWellImages539plateID_14539batchID_72673

批次ID可能与检查有关……一个板子要检查多次，每次检查都有一个批次ID。在imager_pipe目录中的get_barcodes.py脚本中可能有一些线索。

文档

有关更详细的文档，请参阅https://www.cs.diamond.ac.uk/ftrixminer

本地构建和查看文档

git clone git+https://gitlab.diamond.ac.uk/scisoft/bxflow/ftrixminer.git
cd ftrixminer
virtualenv /scratch/$USER/venv/ftrixminer
source /scratch/$USER/venv/ftrixminer/bin/activate
pip install -e .[dev]
make -f .ftrixminer/Makefile validate_docs
browse to file:///scratch/$USER/venvs/ftrixminer/build/html/index.html

待办事项列表

• 改进的待办事项列表

• 更改日志