一个强大且易于使用的fMRI数据预处理管道
项目描述
功能磁共振成像（fMRI）的前处理涉及许多步骤，以在统计分析之前清洁和标准化数据。通常，研究人员为每个数据集创建临时的前处理工作流程，基于大量可用的工具。随着采集和处理的快速发展，这些工作流程的复杂性不断加剧。fMRIPrep是一个分析无关的工具，解决了基于任务和静息态fMRI数据稳健且可重复的前处理挑战。fMRIPrep能够自动适应几乎任何数据集的独特性，确保高质量的前处理而无需手动干预。fMRIPrep稳健地产生高质量的fMRI数据结果。此外，fMRIPrep引入的空间平滑性比常用的前处理工具观察到的要少。fMRIPrep为神经科学家提供了一种易于使用且透明的预处理工作流程，这有助于确保推断的有效性和结果的可解释性。
该工作流程基于Nipype，并包含来自知名神经影像学包的大量工具，包括FSL、ANTs、FreeSurfer、AFNI和Nilearn。此管道旨在为预处理每个状态提供最佳的软件实现，并将随着新的和更好的神经影像学软件的可用性而更新。
fMRIPrep执行基本的前处理步骤（配准、归一化、去卷积、噪声成分提取、分割、去颅骨等），提供可以轻松提交给各种群体水平分析的输出，包括基于任务的或静息态fMRI、图论度量、表面或体积统计等。fMRIPrep允许你轻松做到以下操作
将fMRI数据从未处理（仅重建）转换为分析准备就绪。
实现来自不同软件包的工具。
通过使用最好的工具实现最佳的数据处理质量。
生成预处理评估报告，用户可以轻松识别问题。
接收有关每个受试者预处理阶段的详细输出，包括有意义的错误。
自动化和并行化处理步骤，这为典型的线性、手动处理提供了显著的加速。
[Nat Meth doi:10.1038/s41592-018-0235-4] [文档 fmriprep.org] [软件 doi:10.5281/zenodo.852659] [支持 neurostars.org]
许可证信息
fMRIPrep 遵循 NiPreps 框架 的 通用许可证指南。
许可证
版权（c）NiPreps 开发者。
截至21.0.x预发布和发布系列，fMRIPrep 根据Apache许可证2.0（“许可证”）许可；除非遵守许可证，否则不得使用此文件。您可以在https://apache.ac.cn/licenses/LICENSE-2.0 获取许可证副本。
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源分布
构建发行版
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