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基于阶段的晶体单元识别科学工作流程

项目描述

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简介

flowws-unit-cell 是一套用于识别晶体单元的模块。从高层次来看,这种分析分为4个步骤

  1. 手动选择一个干净、单晶的有序粒子
  2. 选择三个矢量,指定晶体的周期性方向
  3. 将观测结果投影到单元细胞中,并对结果坐标进行聚类
  4. 检测空间群并根据相应中心系统

flowws-unit-cell 使用 flowws-analysis 作为一组模块,在桌面或jupyter笔记本中交互式地实现了此工作流程。

安装

从源安装 flowws-unit-cell

pip install git+https://github.com/glotzerlab/flowws-unit-cell.git#egg=flowws-unit-cell

API文档

在线浏览更详细的文档 在线 或从源构建sphinx文档

git clone https://github.com/glotzerlab/flowws-unit-cell
cd flowws-unit-cell/doc
pip install -r requirements.txt
make html

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上传于 Python 3

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