Python绑定FlatGFA

这是FlatGFA库的Python接口，该库提供了一种高效的方式来表示图形片段组装（GFA）格式中的全基因组变异图。

您可以从PyPI 安装它

$ pip install flatgfa

然后，阅读API文档以获取有关其目前能做什么的详细信息。

开发

要构建此库，首先安装Maturin

$ pipx install maturin

接下来，我们将在我们的虚拟环境中构建和安装Python库。从仓库根目录开始

$ uv venv  # Unless you already created the virtualenv.
$ uv pip install pip  # Maturin depends on pip.
$ source .venv/bin/activate
$ cd flatgfa-py
$ maturin develop

现在flatgfa模块可用于Python程序。尝试我们的示例

$ python example.py

或运行测试

$ uv pip install pytest
$ pytest