firebrowse portal API for Python的绑定
项目描述
描述
firebrowse：Broad Institute TCGA GDAC FireBrowse Portal的Python绑定。
此模块通过Python和UNIX命令行，简化了对firebrowse.org中TCGA数据和分析的编程交互。它提供3组功能
1) 对FireBrowse RESTful API的低级面向对象Python包装器。低级接口中的方法默认在每次调用时返回一页查询结果，以JSON形式。通过指定合适的format=参数，可以返回TSV、CSV和Python字典，并且可以使用合适的page=参数选择多页。有关这些和其他参数的更多详细信息，请参阅set_codec()和param_values()函数。
2) 一个更高级的Python接口，提供对常见生物信息学用例的简化访问。例如，不需要显式实例化对象，并且函数默认在每次调用时返回所有页面的查询结果，以TSV格式。
3) 以及fbget工具，直接从UNIX命令行访问高级接口。
有关更多详细信息、文档和示例，请参阅
发布说明
发布说明可在firebrowse.org上找到，由
https://confluence.broadinstitute.org/display/GDAC/FireBrowse+Release+Notes
有关Firehose数据和数据分析运行的说明可在
https://confluence.broadinstitute.org/display/GDAC/Analysis+Run+Release+Notes https://confluence.broadinstitute.org/display/GDAC/Standardized+Data+Run+Release+Notes
firebrowse-0.1.11.tar.gz 的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 98b72846e28bb4ff5a2e106e2c679941dd44979cf35f946a6a812ff6977c95d5 |
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| MD5 | 6e4aeeae8aa708c216dead496860c320 |
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| BLAKE2b-256 | c5b37ca8101ffc52094f3df8e5767f22086e182853c03da45b6a536881223102 |