用于在Python类中表示各种医学影像文件格式,用于在数据工作流中的类型提示的类
项目描述
这是一个fileformats包的扩展模块,该包添加了对常用医学影像格式(如DICOM(集/目录)、NIfTI和MRtrix Image Format等)的支持...
快速安装
此扩展可以使用pip在Python 3上安装
$ pip3 install fileformats-medimage
这将安装核心包以及任何其他依赖项以验证文件格式。
要使用依赖于第三方包的转换器和元数据读取方法,也请安装相关的extra包
$ pip3 install fileformats-medimage-extras
为了使大多数转换器正常工作,您需要安装Dcm2NiiX和MRtrix软件包。有各种方法可以做到这一点,但在Ubuntu上,您可以使用以下命令安装Dcm2NiiX
$ sudo apt install libopenjp2-7 $ curl -fLO https://github.com/rordenlab/dcm2niix/releases/latest/download/dcm2niix_lnx.zip $ unzip dcm2niix_lnx.zip $ mv dcm2niix /usr/local/bin
(在Mac上,您可以使用Homebrew而不是apt来安装libopenjp2-7)。MRtrix可以用miniconda安装
$ conda install -c mrtrix3 mrtrix3
许可协议
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fileformats_medimage-0.9.4.tar.gz (35.3 kB 查看散列值)
构建分发
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fileformats_medimage-0.9.4.tar.gz 的散列值
算法 | 散列摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | 0d64a2756cb301ec93f24453b0463153523cd5192456f42115a73ed52df61e51 |
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MD5 | 56cb124faf515168e9404b2a78086c30 |
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BLAKE2b-256 | 2cf514c9a111b65bb5da78f1b793f9d8782c97179781f34fcf00d450b12270e2 |
关闭
fileformats_medimage-0.9.4-py3-none-any.whl 的散列值
算法 | 散列摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | 4b4a69f2a02ba61e41c4ebff4bd1c9dab409a5a4af71aefa670bfa43a1a81267 |
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MD5 | 905b478a3f763def16235b26f844991e |
|
BLAKE2b-256 | d10bfbeca27d24e8c52dc39a9da0aeb8a5c96ce849a0c19cad281a3e8ddcc07a |