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最新Life-Line版本的Fiji,方便包含到Python项目中。

项目描述

此软件将下载最新的Life-Line版本的Fiji,提供正确的跨平台二进制文件,并提供一个宏子模块,使从Python自动化Fiji变得简单。

视频演示

image0

本包中当前Fiji Life-Line版本为2014年11月25日

如果您在此模块中遇到任何问题,请提交问题或在github上发送pull请求。

安装

pip install fijibin

用法

>>> import fijibin
>>> fijibin.BIN
'/Users/arve/.bin/Fiji.app/Contents/MacOS/ImageJ-macosx'
>>> fijibin.FIJI_VERSION
'20141125'

fijibin.BIN将指向Linux、Mac或Windows版本,具体取决于通过platform检测到的操作系统。

import fijibin.macro
macro.run(macro_string_or_list_of_strings)

重新获取二进制文件

>>> from fijibin.fetch import fetch
>>> fetch()

更多内容请参阅API参考

开发

安装依赖项并将fijibin的开发版本链接到pip

git clone https://github.com/arve0/fijibin
cd fijibin
pip install -r requirements.txt

运行测试

pip install tox
tox

额外的输出,错误时跳入pdb

DEBUG=fijibin tox -- --pdb -s

构建API参考

pip install -r docs/requirements.txt
make docs

项目详情


下载文件

下载适合您平台文件的文件。如果您不确定选择哪个,请了解有关安装包的更多信息。

源分布

fijibin-0.3.0.tar.gz (727.7 kB 查看散列)

上传于 源代码

构建分发

fijibin-0.3.0-py3-none-any.whl (7.9 kB 查看哈希)

上传于 Python 3

由以下支持