可视化外显子和它们的阅读框
项目描述
Exonviz
ExonViz是一个简单工具,用于生成和绘制包含编码区和非编码区的转录本。所有外显子都按比例绘制,外显子的阅读框也可见。可以在转录本上绘制单个或多个变异,并将它们自动显示在正确的位置。
在线版本
您可以在exonviz.rnatherapy.nl尝试使用ExonViz在线版本。
安装
ExonViz仅需要Python,可以使用PIP进行安装
pip install exonviz
用法
只需提供转录本(带版本!),或将有效的HGVS描述提供给exonviz以生成图形
exonviz --transcript "NM_003002.4:r.[274G>T;300del]" > SHDH.svg
文档
ExonViz的文档可在Readthedocs上找到,包括一些使用ExonViz命令行版本的示例。
项目详情
下载文件
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源分布
exonviz-0.2.13.tar.gz (197.4 kB 查看哈希值)
构建分布
exonviz-0.2.13-py3-none-any.whl (194.9 kB 查看哈希值)