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EEGIO:一个兼容MNE-Python和MNE-BIDS的eeg数据io包。

项目描述

EEG IO

Build Status Coverage Status Code style: black GitHub PyPI GitHub last commit GitHub repo size

用于轻松与EDF格式的EEG数据或BIDS-EEG布局中的FIF格式进行接口的API。此模块存储了人类患者EEG数据IO的代码,以及将临床中心数据(即时间序列eeg,临床元数据)转换为开发者友好型数据集的管道代码,该数据集可逆且易于调试。

待办事项

  • 添加通过神经影像处理数据(例如FreeSurfer)添加结构上下文的支持

安装指南

EEGio旨在作为分析大量EEG数据的轻量级包装。eegio依赖于以下库来工作

numpy
scipy
scikit-learn
pandas
mne
mne-bids
pybids
seaborn
matplotlib
pyedflib (deprecated)
xlrd (deprecated)

安装指南

预期用户/用途

处理符合BIDS和MNE格式的EEG数据的癫痫研究人员。任何有人类患者EEG数据的人。
请参阅示例和文档,了解如何格式化这些信息。

设置BIDS目录和从EDF/FiF读取EEG数据

这些只是MNE/pyedflib读取的轻量级包装,以便轻松加载EDF/FiF数据,从而使原始EEG时间序列数据以Python友好格式易于访问。我们提供了一个基于MNE-BIDS示例构建的示例。请参见示例

有关更多信息,请参阅教程和文档。

贡献

我们欢迎任何人的贡献。请查看我们的贡献指南。我们的问题页面是提出建议的好地方!如果您有未列出的改进想法,请先创建一个问题,以便您能与开发者进行讨论。有关设置测试的信息,请参阅测试指南

许可证

本项目受GNU GPL许可证的保护。

项目详情


下载文件

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源分发

eegio-0.1.3.tar.gz (63.4 kB 查看哈希)

上传时间

构建分发

eegio-0.1.3-py3-none-any.whl (68.7 kB 查看哈希)

上传时间 Python 3

支持者

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