EEGIO:一个兼容MNE-Python和MNE-BIDS的eeg数据io包。
项目描述
EEG IO
用于轻松与EDF格式的EEG数据或BIDS-EEG布局中的FIF格式进行接口的API。此模块存储了人类患者EEG数据IO的代码,以及将临床中心数据(即时间序列eeg,临床元数据)转换为开发者友好型数据集的管道代码,该数据集可逆且易于调试。
待办事项
- 添加通过神经影像处理数据(例如FreeSurfer)添加结构上下文的支持
安装指南
EEGio旨在作为分析大量EEG数据的轻量级包装。eegio依赖于以下库来工作
numpy
scipy
scikit-learn
pandas
mne
mne-bids
pybids
seaborn
matplotlib
pyedflib (deprecated)
xlrd (deprecated)
见安装指南
预期用户/用途
处理符合BIDS和MNE格式的EEG数据的癫痫研究人员。任何有人类患者EEG数据的人。
请参阅示例和文档,了解如何格式化这些信息。
- https://github.com/bids-standard/bids-specification/blob/master/src/04-modality-specific-files/04-intracranial-electroencephalography.md
- https://github.com/bids-standard/bids-starter-kit/wiki/The-BIDS-folder-hierarchy
设置BIDS目录和从EDF/FiF读取EEG数据
这些只是MNE/pyedflib读取的轻量级包装,以便轻松加载EDF/FiF数据,从而使原始EEG时间序列数据以Python友好格式易于访问。我们提供了一个基于MNE-BIDS示例构建的示例。请参见示例。
有关更多信息,请参阅教程和文档。
贡献
我们欢迎任何人的贡献。请查看我们的贡献指南。我们的问题页面是提出建议的好地方!如果您有未列出的改进想法,请先创建一个问题,以便您能与开发者进行讨论。有关设置测试的信息,请参阅测试指南。
许可证
本项目受GNU GPL许可证的保护。
项目详情
下载文件
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源分发
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构建分发
eegio-0.1.3-py3-none-any.whl (68.7 kB 查看哈希)
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eegio-0.1.3.tar.gz的哈希
算法 | 哈希摘要 | |
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SHA256 | 1f392d11fd7f3a1276cce0bc4762d47aa16f731cae41962f543566fa3b008dff |
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MD5 | cd2ae243de1b29f2449314a1deb2fd7f |
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BLAKE2b-256 | 078515b798e7390793bea7144b76bd8ef545b7cfead95b4d9b65e1a56d2c2d06 |
关闭
eegio-0.1.3-py3-none-any.whl的哈希
算法 | 哈希摘要 | |
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SHA256 | a56eeb5a21d8fafc1d01e89ac2fd955bfb6486b11ce320e93418edaa86e824a6 |
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