Dynamo2Relion

将Dynamo表格转换为RELION 4.0星文件的小工具

基于Alister Burt的dynamo2m。

安装

安装通过以下方式执行

pip install dynamo2relion

需求

包含倾斜系列目录的您的目录必须按照以下结构组织

tilt_series_directory #Directory containing all TS directories, link to this directory
|
--> TS_01 #Directory containing TS_01              
       |
       --> TS_01.mrc #TS_01  image stack. The file extension does not matter.        
|
--> TS_02              
       |
       -->TS_02.mrc  #
|
--> etc...

程序将询问tilt_series_directory的路径。tilt_series_directory中不应包含除TS_*目录以外的其他目录。TS_*目录的命名规范可以是任意大小写混合的TS和任何所需的编号规范。

用法

使用说明可以通过输入以下内容找到

dynamo2relion --help

对于分箱级别，如果您的Dynamo表格中粒子的坐标是从未分箱的重组体中选取的，则直接输入1。如果选取粒子的重组体是分箱的，请添加正确的分箱级别：分箱使用IMOD规范进行，例如，对于1 A/px的像素大小，分箱级别为8会产生8 A/px。