dupin 0.1

概述

dupin 设计用于提供一个无偏见的 Python API，用于将时间点云数据分割成稳定区域和过渡区域。通常这类数据来自分子模拟或实验成像技术。例如，如果一位研究人员对金纳米粒子在面心立方晶体中成核的过程进行了成像，dupin 可以帮助将系统分割成初始流体、过渡和晶体区域。尽管 dupin 力求通用和无偏见，但我们提供了合理的默认设置，同时不牺牲易用性以换取可定制性。

资源

• 文档：阅读我们的 API 文档。

• 安装指南：查看我们的安装指南。

• GitHub 仓库：查看源代码。

• 问题跟踪器：提交错误报告或拉取请求。

相关工具

• HOOMD-blue：分子模拟引擎

• freud：分子轨迹分析

• ruptures：变化点检测库

• kneed：拐点检测库

示例

import dupin as du
import numpy as np
import ruptures as rpt

signal = np.load("signal.npy")
dynp = rpt.Dynp(custom_cost=du.detect.CostLinearFit())
detector = du.detect.SweepDetector(dynp, 8)

chps = detector.fit(signal)

致谢

本软件包是用 Cookiecutter 创建的，基于对 audreyr/cookiecutter-pypackage 的修改版本。