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用于探索深度测序数据的实用工具。

项目描述

deepTools解决了处理来自DNA测序中心的常规生成的大量数据的挑战。deepTools包含用于多个质量检查的处理比对读数数据的实用模块,创建标准bedGraph和bigWig文件格式中的标准化覆盖文件,允许比较不同文件(例如,处理组和对照组)。最后,使用这些规范化和标准化的文件,deepTools可以创建许多可用于识别富集和基因组功能注释的出版物准备好的可视化。

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引用

拉米雷斯 F,瑞恩 DP,格鲁宁 B,巴哈杜瓦 V,基尔佩特 F,里希特 AS,海因 S,邓达尔 F,曼克 T. deepTools2:下一代深度测序数据分析网络服务器。 核酸研究。2016 年 4 月 13 日:gkw257。

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源代码分布

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构建分布

deepTools-3.5.5-py3-none-any.whl (208.7 kB 查看哈希值)

上传时间 Python 3

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