datathief 0.3

安装

常规操作：pip install datathief。

用法

与Java DataThief包和类似在线工具不同，在这里用户需要手动标注图像中他们选择的数据点。这使得数据读取过程更加透明，并使得结果更具可重复性。然而，对于大量数据来说可能会很烦人。

如果您想提取大量数据或从连续线中提取数据，您最好使用原始的Java DataThief包或众多在线工具之一，这些工具正是为此目的而设计的。

要使用此工具，首先通过在指定的颜色（默认颜色：纯蓝）中添加一个像素在x轴的起始和结束处进行标注，该颜色在图像的任何其他地方都不存在。同样为y轴标注（默认颜色：纯红）。然后为要提取的每个数据点添加一个像素（默认颜色：纯绿）。然后此功能将返回每个数据点的x和y坐标。如果检测到像素过多或过少，它将警告您。

例如，运行以下代码

import datathief as dt
filename = 'du_fig1a_annotated.png'
xlim = [-10, 20]
ylim = [0, 15]
data = dt.datathief(filename, xlim=xlim, ylim=ylim)

在此输入（注意，您可能需要放大才能看到单个像素）

提取此图表的数据

请参阅示例文件夹以获取更多信息。（图由Du等人提供，https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.19.20025452v4）

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