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Python包,提供保存分数的检索。

项目描述

自动检索和预处理保存分数的管道

安装包

对于任何Python包,只需运行

pip install conservation_scores_dataset

使用示例

以下两个使用示例将展示如何运行管道以及如何检索存储在此GitHub存储库中的已预计算的值。

运行管道以检索数据

如果您想自己运行管道,请注意该存储库中已提供一些预处理的数据,下载的文件将需要总大小为ADDSIZE。

安装包后,只需运行以下命令即可检索与FANTOM5和ROADMAP数据集中增强子和启动子相关的一切数据

from conservation_scores_dataset import retrieve_all
retrieve_all()

它将显示一些加载栏,显示管道在特定时间正在做什么,如下所示

https://github.com/LucaCappelletti94/conservation_scores_dataset/blob/main/example_screenshot.png?raw=true

基于retrieve_all文件中的主循环,可以轻松构建针对其他BED文件的类似自动检索管道。

项目详情


下载文件

下载适合您的平台的文件。如果您不确定选择哪个,请了解更多关于 安装包 的信息。

源分布

conservation_scores_dataset-0.0.1.tar.gz (5.0 kB 查看哈希值)

上传时间:

支持