组成数据分析
项目描述
Python模块,用于组成数据分析。使用pip安装
pip install composition_stats
提供以下功能
closure |
执行闭包以确保所有元素加起来为1。 |
multiplicative_replacement |
将所有零替换为小的非零值 |
perturb |
执行扰动操作。 |
perturb_inv |
执行逆扰动操作。 |
power |
执行幂操作。 |
inner |
计算Aitchson内积。 |
clr |
执行中心对数比率转换。 |
clr_inv |
执行逆中心对数比率转换。 |
ilr |
执行等距对数比率转换。 |
ilr_inv |
执行逆等距对数比率变换。 |
alr |
执行加法对数比率转换。 |
alr_inv |
执行逆加法对数比率变换。 |
center |
计算数据的几何平均数。 |
centralize |
将数据围绕其几何平均数进行中心化。 |
sbp_basis |
从顺序二进制划分(SBP)构建正交基。 |
有关详细信息及完整函数参考,请参阅文档。
这是从scikit-bio中的skbio.stats.composition模块的必要组成数据函数的分支。然而,出于性能原因,此模块中的函数期望输入的组成已经加起来为1,并且内部不会对输入调用closure()。