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组成数据分析

项目描述

Tests Documentation Status

Python模块,用于组成数据分析。使用pip安装

pip install composition_stats

提供以下功能

closure

执行闭包以确保所有元素加起来为1。

multiplicative_replacement

将所有零替换为小的非零值

perturb

执行扰动操作。

perturb_inv

执行逆扰动操作。

power

执行幂操作。

inner

计算Aitchson内积。

clr

执行中心对数比率转换。

clr_inv

执行逆中心对数比率转换。

ilr

执行等距对数比率转换。

ilr_inv

执行逆等距对数比率变换。

alr

执行加法对数比率转换。

alr_inv

执行逆加法对数比率变换。

center

计算数据的几何平均数。

centralize

将数据围绕其几何平均数进行中心化。

sbp_basis

从顺序二进制划分(SBP)构建正交基。

有关详细信息及完整函数参考,请参阅文档

这是从scikit-bio中的skbio.stats.composition模块的必要组成数据函数的分支。然而,出于性能原因,此模块中的函数期望输入的组成已经加起来为1,并且内部不会对输入调用closure()

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