Cell Feature Data

用于创建和验证Cell Feature Explore细胞特征数据集的Python包。

文档

有关完整文档，请参阅Github上的完整文档。

安装

pip install cell-feature-data

用法

为Cell Feature Explore创建单个数据集或大型数据集

在终端中运行以下命令：create-dataset

此命令将引导您完成以下步骤

1. 指定输入文件的路径：支持的格式：.csv（未来版本中将添加更多格式）。
2. 设置输出目录：提供保存生成的数据集文件的路径。如果未指定，将在data目录中创建一个新的数据集文件夹，命名为输入文件。
3. 处理输入文件：该工具将根据输入数据计算并生成必要的JSON文件。
4. 输入额外元数据：您将被提示添加有关数据集的更多详细信息，这些信息将用于更新生成的JSON文件。

在您的Python脚本中导入和使用该包

   from cell_feature_data.bin.create_dataset import main


   # Call the main function
   if __name__ == "__main__":
      main()

数据集规范

有关数据集结构和设置的更多信息，请参阅完整规范文档