用于对fMRI数据进行共激活模式分析的工具。
项目描述
Capcalc
capcalc是一套用于对时间序列数据进行共激活模式分析的Python程序。它使用K-Means聚类来找到一组“激活状态”，这些状态代表数据中的相关模式。
HTML文档在这里： http://capcalc.readthedocs.io/en/latest/
注意
这是一个不断发展的代码库。我一直在对其进行调整。话虽如此，现在我将它发布到世界，我将更加负责地锁定稳定的发布点。然而，在发布之间，我仍然会对其进行修改。 在修改过程中，我可能会破坏某些功能，因此如果在发布之间下载代码，请检查状态更新。我最终变得更现代化，并开始添加自动测试，因此随着时间的推移，希望“发布之间”的版本将更加可靠。经常回来查看令人兴奋的新功能和错误修复！
好吧，我已经决定。里面有什么？
roidecompose - 此程序使用图谱从4D nifti文件中提取时间序列，生成一个文本文件，其中包含图谱中每个区域的平均时间序列（文件中的每个积分值）的列。这可以输入到capfromtcs中。时间序列有各种归一化选项。
capfromtcs - 该工具执行实际的CAP计算，对时间序列集合进行k-means聚类分析，以找到文件中“状态”的最佳代表性集合。输出找到的状态以及时间序列每个时间点的优势状态。
maptoroi - roidecompose的逆操作。给定一组聚类时间序列和一个模板文件，它将值映射回ROI。
statematch - 使用此工具对两个状态输出文件进行对齐。接受两个状态时间序列文件，并确定第二个文件中的哪些状态对应于第一个文件中的哪些状态。生成一个新的“重新映射”文件，其中第二个文件中的状态用第一个文件中的状态表示。
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capcalc-1.3.9.tar.gz的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 03b4dcccfb63d472d7b80a66acb700622e4ae9bc00445481aa01f2dba657731e |
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capcalc-1.3.9-py2.py3-none-any.whl的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
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| SHA256 | 374fc42d935c2dedf7f45f3e0d24e0da794d2f9b57c97809a4c47a7bb486ed58 |
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