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项目描述
CAMPA是一个用于亚细胞多通道成像数据的定量分析框架。它由一个工作流程组成,该工作流程使用条件变分自编码器(cVAE)生成一致的亚细胞标记(CSL)。CAMPA工作流程的输出是一个anndata对象,其中包含可解释的每细胞特征,总结了每个细胞内CSL的分子组成和空间排列。
请访问我们的文档了解安装和使用示例。
论文
请参阅我们的预印本《通过学习一致的亚细胞标记来量化多通道蛋白质图谱的变化》 (Spitzer, Berry et al. (2022)) 以了解更多信息。
安装
CAMPA是为Python 3.9开发的,可以通过运行以下命令进行安装
pip install campa
贡献
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项目详情
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源代码分布
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campa-1.1.0-py3-none-any.whl (101.9 kB 查看哈希值)
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campa-1.1.0-py3-none-any.whl的哈希值
算法 | 哈希摘要 | |
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SHA256 | 8622d0fd7c46989d089b9f49c495c2d7db8dc75d962d2d355ccf7e15e4b019b3 |
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MD5 | a5b9bc5e97f677422e32da997518c166 |
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BLAKE2b-256 | f2b828100a507c5e9eeb61fac08a65424cb41de2b8a526929e33f6945712adb7 |