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项目描述

CAMPA是一个用于亚细胞多通道成像数据的定量分析框架。它由一个工作流程组成,该工作流程使用条件变分自编码器(cVAE)生成一致的亚细胞标记(CSL)。CAMPA工作流程的输出是一个anndata对象,其中包含可解释的每细胞特征,总结了每个细胞内CSL的分子组成和空间排列。

CAMPA title figure

请访问我们的文档了解安装和使用示例。

论文

请参阅我们的预印本《通过学习一致的亚细胞标记来量化多通道蛋白质图谱的变化》 (Spitzer, Berry et al. (2022)) 以了解更多信息。

安装

CAMPA是为Python 3.9开发的,可以通过运行以下命令进行安装

pip install campa

贡献

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项目详情


下载文件

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源代码分布

本发布版本没有提供源代码分布文件。请参阅生成分布存档的教程

构建分布

campa-1.1.0-py3-none-any.whl (101.9 kB 查看哈希值)

上传时间 Python 3

支持者

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