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Python自由能计算

项目描述

calphy

calphy(发音为 cal-phee) 是一个Python库和命令行工具,用于自由能计算。它使用 LAMMPS 作为分子动力学驱动程序,以完全自动化和高效的方式使用热力学积分来计算自由能。calphy可以执行的各种方法是

Calphy与LAMMPS中实现的所有原子间势函数兼容,并且可以在50 ps的模拟时间和少于3000个原子的条件下获得低误差条带的结果。关于calphy中的方法,请参阅相关出版物

安装、示例和文档

  • 请在此阅读calphy的安装说明和文档,包括示例。

  • 有关calphy中实现的方法和算法的描述,请参阅相关出版物

  • 有关calphy出版物中展示的一组示例,请参阅此处

引用calphy

如果您觉得calphy很有用,请考虑引用
Menon, Sarath, Yury Lysogorskiy, Jutta Rogal, and Ralf Drautz。
“从原子模拟自动计算自由能。” 物理评论材料 5(10), 2021
DOI: 10.1103/PhysRevMaterials.5.103801

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