cadccutout 0.4.1

示例1

使用cfitsio cutout字符串格式对文件执行cutout。

import tempfile
from cadccutout import OpenCADCCutout

test_subject = OpenCADCCutout()
output_file = tempfile.mkstemp(suffix='.fits')
input_file = '/path/to/file.fits'

# Cutouts are in cfitsio format.
cutout_region_string = '[300:800,810:1000]'  # HDU 0 along two axes.

# Needs to have 'append' flag set.  The cutout() method will write out the data.
with open(output_file, 'ab+') as output_writer, open(input_file, 'rb') as input_reader:
    test_subject.cutout(input_reader, output_writer, cutout_region_string, 'FITS')

示例2（CADC）

从HTTP请求的输入流中执行cutout。

import tempfile
from cadccutout import OpenCADCCutout
from cadcdata import CadcDataClient

test_subject = OpenCADCCutout()
anonSubject = net.Subject()
data_client = CadcDataClient(anonSubject)
output_file = tempfile.mkstemp(suffix='.fits')
archive = 'HST'
file_name = 'n8i311hiq_raw.fits'
input_stream = data_client.get_file(archive, file_name)

# Cutouts are in cfitsio format.
cutout_region_string = '[SCI,10][80:220,100:150]'  # SCI version 10, along two axes.

# Needs to have 'append' flag set.  The cutout() method will write out the data.
with open(output_file, 'ab+') as output_writer:
    test_subject.cutout(input_stream, output_writer, cutout_region_string, 'FITS')

运行

cadccutout -d --infile path/to/source.fits --outfile path/to/output.fits [100:400]

cadccutout -d --infile path/to/source.fits --outfile path/to/output.fits "CIRCLE=10 60 0.5"

在Docker中运行

提供的 Dockerfile 可以用来根据所需的 Python 版本构建镜像。

构建 Python 2.7 的镜像

docker build --build-arg PYTHON_VERSION=2.7 -t opencadc/cadccutout:2.7-alpine .

然后执行它（/usr/src/data 是源文件的存放位置）。这将输出到标准输出

docker run --rm -v $(pwd):/usr/src/data opencadc/cadccutout:2.7-alpine cadccutout --infile /usr/src/data/myfile.fits [100:400]

或者

docker run --rm --mount type=bind,source=$(pwd),target=/usr/src/data opencadc/cadccutout:2.7-alpine cadccutout --infile /usr/src/data/myfile.fits [100:400]

构建 Python 3.6 的镜像

docker build --build-arg PYTHON_VERSION=3.6 -t opencadc/cadccutout:3.6-alpine .

然后执行它（/usr/src/data 是源文件的存放位置）。这将输出到 FITS 文件

docker run --rm -v $(pwd):/usr/src/data opencadc/cadccutout:3.6-alpine cadccutout --infile /usr/src/data/myfile.fits --outfile /usr/src/data/mycutout_0_100_400.fits [100:400]

或者

docker run --rm --mount type=bind,source=$(pwd,target=/usr/src/data opencadc/cadccutout:3.6-alpine cadccutout --infile /usr/src/data/myfile.fits --outfile /usr/src/data/mycutout_0_100_400.fits [100:400]

在 Docker 中运行测试

您可以将本地开发目录挂载到镜像中，并通过这种方式运行 Python 测试。从 dev（工作）目录内部

Python 3.7

docker run --rm -v $(pwd):/usr/src/app opencadc/astroquery:3.7-alpine python setup.py test

或者

docker run --rm --mount type=bind,source=$(pwd),target=/usr/src/app opencadc/astroquery:3.7-alpine python setup.py test

Python 2.7

docker run --rm -v $(pwd):/usr/src/app opencadc/astroquery:2.7-alpine python setup.py test

或者

docker run --rm --mount type=bind,source=$(pwd),target=/usr/src/app opencadc/astroquery:2.7-alpine python setup.py test