用于细胞分割、跟踪、将细胞分类为升阴性细胞和升阳性细胞以及随时间测量钙强度的软件包
项目描述
dzne计算服务器的安装说明。–在python版本2.7.7上测试过– Christoph Moehl，christoph.moehl@dzne.de
在您的客户端计算机上安装x转发软件，例如 http://xquartz.macosforge.org/landing/（如果尚未安装）
2. 登录到dzne计算服务器之一，例如 ssh -Y compute-04.dzne.de
3. 加载python模块 module load python
4. 在您的家目录中安装virtualenv（如果尚未安装） easy_install -d /home/[username]/.python27 –user virtualenv
5. 创建一个项目目录和一个新的虚拟环境（这里使用名称 venv - 其他名称是可能的） mkdir my_project cd my_project /home/[username]/.local/bin/virtualenv venv
6. 激活虚拟环境并安装python包 numpy, six, pandas 和 scipy source venv/bin/activate pip install numpy==1.8.1 pip install six pip install pandas pip install scipy
7. 最后安装ca_tracker pip install ca_tracker
编辑config.json文件以设置分析参数
现在您可以运行ca_tracker_1和ca_tracker_2
您可以使用命令pip freeze检查已安装的模块
关闭
ca_tracker-0.2.11.tar.gz 的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 612768f02d9603968eddcf51dd831e23b8624b11e5bf94e1c7bc03de834fa36b |
|
| MD5 | 716500882782a88750d8116cd62edf51 |
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| BLAKE2b-256 | aaa476b47b9b8e775633ec96a6b9598ef046404f5afe2939d78965c8ddf0d71d |