生物链接模型工具包 - 轻量版！

bmt-lite 是 bmt 子集的零依赖近克隆。它支持许多常用 bmt 方法的输入/输出对预填充的缓存。

bmt 本身占磁盘空间约127 KB，但与其所有依赖项一起，它需要约36.2 MB。另一方面，bmt-lite-1.8.2 在磁盘上约295 KB，其中约254 KB是缓存数据。从 bmt 初始化工具包需要约2秒，而从 bmt-lite 初始化工具包需要约2e-7秒。因为 bmt-lite 的所有行为都是预先缓存的，所以它不需要在运行时连接到互联网。

* 所有测量都在一个典型的星期二下午进行

注意： bmt-lite 并未实现 bmt 的所有功能。欢迎提出功能请求（或拉取请求？！）。此外，现有功能可能略有不同；例如，bmt-lite 的元素名/ID格式转换对于某些特殊情况已知是不同的。

安装

您必须安装与您想要的生物链接模型版本对应的特定“口味”的 bmt-lite。目前有1.7.0 - 2.2.5版本可用。

例如，

pip install bmt-lite-1.8.2

用法

几乎像使用 bmt 一样使用 bmt-lite： https://github.com/biolink/biolink-model-toolkit#usage

开发

构建

pip install -rrequirements-build.txt
./build.sh

测试

pip install -rrequirements-test.txt
tox

发布

pip install twine
twine upload dist/*