生物链模型工具包 - 精简版！

bmt-lite 是 bmt 的一个子集的零依赖近似克隆，它由许多常用 bmt 方法的输入/输出对组成的预填充缓存支持。

bmt 独立在磁盘上占用 ~127 KB，但与其所有依赖项一起，它需要 ~36.2 MB。另一方面，bmt-lite-1.8.2 在磁盘上占用 ~295 KB，其中 ~254 KB 是缓存数据。从 bmt 初始化工具包需要 ~2 秒，而从 bmt-lite 初始化工具包需要 ~2e-7 秒。由于 bmt-lite 的所有行为都是预先缓存的，因此它不需要在运行时访问互联网。

* 所有测量都是在随机星期二的下午在一个典型的笔记本电脑上进行的

注意： bmt-lite 并没有实现 bmt 的所有功能。欢迎提出功能请求（或拉取请求？！）。此外，现有功能可能略有不同；例如，bmt-lite 的元素名/ID格式转换在特殊情况下已知会有所不同。

安装

您必须安装与您想要的生物链模型版本相对应的特定“口味”的 bmt-lite。目前有 1.7.0 - 2.2.5 版本可用。

例如，

pip install bmt-lite-1.8.2

使用方法

使用 bmt-lite 几乎与您使用 bmt 本身一样：[https://github.com/biolink/biolink-model-toolkit#usage](https://github.com/biolink/biolink-model-toolkit#usage)

开发

构建

pip install -rrequirements-build.txt
./build.sh

测试

pip install -rrequirements-test.txt
tox

发布

pip install twine
twine upload dist/*