生物链模型工具包 - 轻量版！

bmt-lite 是 bmt 的一个子集的零依赖近似克隆。它背后是一个预先填充的输入/输出对的缓存，用于许多常用的 bmt 方法。

bmt 本身占据了 ~127 KB 的磁盘空间，但与其所有依赖项一起，它占据了 ~36.2 MB。另一方面，bmt-lite-1.8.2 在磁盘上大约是 ~295 KB，其中 ~254 KB 是缓存数据。从 bmt 初始化工具包需要 ~2 秒，而从 bmt-lite 初始化工具包需要 ~2e-7 秒。由于 bmt-lite 的所有行为都是预先缓存的，它不需要在运行时连接到互联网。

* 所有测量均在典型的笔记本电脑上随机周二下午进行

注意：bmt-lite 并未实现 bmt 的所有功能。欢迎提出功能请求（或拉取请求？！）。此外，现有功能可能略有不同；例如，bmt-lite 的元素名/ID格式转换在特定情况下已知存在差异。

安装

您必须安装与您想要的生物链模型版本相对应的特定“版本”的 bmt-lite。目前有 1.7.0 - 2.2.5 版本可供使用。

例如，

pip install bmt-lite-1.8.2

使用方法

使用 bmt-lite 的方式几乎与使用 bmt 本身一样：[https://github.com/biolink/biolink-model-toolkit#usage](https://github.com/biolink/biolink-model-toolkit#usage)

开发

构建

pip install -rrequirements-build.txt
./build.sh

测试

pip install -rrequirements-test.txt
tox

发布

pip install twine
twine upload dist/*