生物链模型工具包 - 轻量版！

bmt-lite 是 bmt 子集的零依赖近似克隆。它支持许多常用 bmt 方法的输入/输出对的预填充缓存。

bmt 本身占磁盘空间约127 KB，但包括所有依赖项在内，占用约36.2 MB。另一方面，bmt-lite-1.8.2 在磁盘上约为295 KB，其中约254 KB是缓存数据。从 bmt 初始化工具包需要约2秒，而从 bmt-lite 初始化工具包需要约2e-7秒。因为 bmt-lite 的所有行为都是预先缓存的，所以运行时不需要互联网。

所有测量都在一个典型的笔记本电脑上在一个随机的周二下午进行

注意： bmt-lite 并没有实现 bmt 的所有功能。欢迎提出功能请求（或拉取请求？！）。此外，现有功能可能略有不同；例如，bmt-lite 的元素名称/ID格式转换在特殊情况下已知会有所不同。

安装

您必须安装与您想要的生物链模型版本相对应的特定“版本”的 bmt-lite。目前有1.7.0 - 2.2.5版本。

例如，

pip install bmt-lite-1.8.2

用法

使用 bmt-lite 几乎与使用 bmt 本身完全相同：[链接](https://github.com/biolink/biolink-model-toolkit#usage)

开发

构建

pip install -rrequirements-build.txt
./build.sh

测试

pip install -rrequirements-test.txt
tox

发布

pip install twine
twine upload dist/*