生物链接模型工具包 - 轻量版！

bmt-lite 是bmt子集的零依赖近似克隆。它由许多常用 bmt 方法的输入/输出对预先填充的缓存支持。

bmt 本身占用约127 KB磁盘空间，但与其所有依赖项一起，它需要约36.2 MB。另一方面，bmt-lite-1.8.2 在磁盘上占用约295 KB，其中约254 KB是缓存数据。从 bmt 初始化工具包需要约2秒，而从 bmt-lite 初始化工具包需要约2e-7秒。由于 bmt-lite 的所有行为都是预先缓存的，因此它在运行时不需要互联网。

* 所有测量均在随机周二下午的典型笔记本电脑上完成

注意: bmt-lite 并未实现 bmt 的所有功能。欢迎提出功能请求（或拉取请求?!）。此外，现有功能可能略有不同；例如，bmt-lite 的元素名称/ID格式转换已知在某些特殊情况下会有所不同。

安装

您必须安装与您想要的生物链接模型版本相对应的特定“口味”的bmt-lite。目前有1.7.0 - 2.2.5版本可用。

例如，

pip install bmt-lite-1.8.2

用法

使用bmt-lite几乎与使用bmt本身完全相同：[https://github.com/biolink/biolink-model-toolkit#usage](https://github.com/biolink/biolink-model-toolkit#usage)

开发

构建

pip install -rrequirements-build.txt
./build.sh

测试

pip install -rrequirements-test.txt
tox

发布

pip install twine
twine upload dist/*