生物链模型工具包 - 轻量版！

bmt-lite 是 bmt 的一个子集的零依赖近似克隆。它支持许多常用 bmt 方法的输入/输出对的预填充缓存。

bmt 本身占磁盘空间约 127 KB，但包含所有依赖项时，占约 36.2 MB。另一方面，bmt-lite-1.8.2 在磁盘上约为 295 KB，其中约 254 KB 是缓存数据。从 bmt 初始化工具包需要约 2 秒，而从 bmt-lite 初始化工具包需要约 2e-7 秒。因为 bmt-lite 的所有行为都是预先缓存的，所以运行时不需要互联网。

* 所有测量均在随机星期二下午的典型笔记本电脑上完成

注意：bmt-lite 并未实现所有 bmt 的功能。欢迎提出功能请求（或拉取请求？！）。此外，现有功能可能略有差异；例如，bmt-lite 的元素名称/ID 格式转换在某些特殊情况下已知有所不同。

安装

您必须安装与您想要的 Biolink 模型版本相对应的特定“版本”的 bmt-lite。目前有 1.7.0 - 2.2.5 版本可用。

例如，

pip install bmt-lite-1.8.2

使用方法

使用 bmt-lite 的方式几乎与使用 bmt 本身完全相同：https://github.com/biolink/biolink-model-toolkit#usage

开发

构建

pip install -rrequirements-build.txt
./build.sh

测试

pip install -rrequirements-test.txt
tox

发布

pip install twine
twine upload dist/*