生物链接模型工具包 - 精简版！

bmt-lite 是 bmt 部分功能的零依赖近似克隆。它支持许多常用 bmt 方法输入/输出对的预填充缓存。

bmt 本身占用磁盘空间约为 ~127 KB，但包含所有依赖项后，占用 ~36.2 MB。另一方面，bmt-lite-1.8.2 在磁盘上的大小约为 ~295 KB，其中 ~254 KB 是缓存数据。从 bmt 初始化工具包需要 ~2 秒，而从 bmt-lite 初始化工具包需要 ~2e-7 秒。由于 bmt-lite 的所有行为都是预缓存的，因此运行时不需要互联网。

* 所有测量都是在典型的笔记本电脑上在某个随机的周二下午进行的

注意：bmt-lite 并未实现 bmt 的所有功能。欢迎提出功能请求（或者拉取请求？！）。此外，现有的功能可能略有不同；例如，bmt-lite 的元素名/ID 格式转换在某些特殊情况下已知有差异。

安装

您必须安装与您想要的 Biolink 模型版本相对应的特定 "flavor" 的 bmt-lite。目前有 1.7.0 - 2.2.5 版本可用。

例如，

pip install bmt-lite-1.8.2

使用方法

使用 bmt-lite 几乎与使用 bmt 本身完全一样：[https://github.com/biolink/biolink-model-toolkit#usage](https://github.com/biolink/biolink-model-toolkit#usage)

开发

构建

pip install -rrequirements-build.txt
./build.sh

测试

pip install -rrequirements-test.txt
tox

发布

pip install twine
twine upload dist/*