生物链模型工具包 - 精简版！

bmt-lite 是 bmt 部分功能的零依赖近克隆。它支持预填充的输入/输出对缓存，许多常用 bmt 方法都有这些缓存。

bmt 独立版本在磁盘上占用约127 KB，但包括所有依赖项在内，总占用约为36.2 MB。另一方面，bmt-lite-1.8.2 在磁盘上占用约295 KB，其中约254 KB是缓存数据。从 bmt 初始化工具包需要约2秒，而从 bmt-lite 初始化工具包只需要约2e-7秒。由于 bmt-lite 的所有行为都是预先缓存的，因此运行时不需要互联网。

* 所有测量都是在随机星期二下午的典型笔记本电脑上进行的

注意：bmt-lite 并未实现 bmt 的所有功能。欢迎提出功能请求（或拉取请求？！）。此外，现有功能可能略有不同；例如，bmt-lite 的元素名/ID格式转换在特殊情况下可能与 bmt 不同。

安装

您必须安装与您想要的Biolink模型版本对应的特定“版本”的bmt-lite。目前版本1.7.0 - 2.2.5可用。

例如：

pip install bmt-lite-1.8.2

用法

使用bmt-lite的方式几乎与使用bmt本身相同：[https://github.com/biolink/biolink-model-toolkit#usage](https://github.com/biolink/biolink-model-toolkit#usage)

开发

构建

pip install -rrequirements-build.txt
./build.sh

测试

pip install -rrequirements-test.txt
tox

发布

pip install twine
twine upload dist/*