生物链模型工具包 - 轻量版！

bmt-lite 是 bmt 零依赖子集的近似克隆。它支持许多常用 bmt 方法输入/输出对的预填充缓存。

bmt 单独在磁盘上占用 ~127 KB，但所有依赖项一起占用 ~36.2 MB。另一方面，bmt-lite-1.8.2 在磁盘上占用 ~295 KB，其中 ~254 KB 是缓存数据。从 bmt 初始化工具包需要 ~2 秒，而从 bmt-lite 初始化工具包需要 ~2e-7 秒。因为 bmt-lite 的所有行为都是预先缓存的，所以它不需要在运行时使用互联网。

所有测量都是在典型的笔记本电脑上在某个星期二的下午进行的

注意： bmt-lite 并未实现 bmt 的所有功能。欢迎功能请求（或拉取请求？！）。此外，现有功能可能略有不同；例如，bmt-lite 的元素名称/ID格式转换在某些特殊情况下已知不同。

安装

您必须安装与您想要的Biolink模型版本相对应的特定“版本”的bmt-lite。目前可用版本为1.7.0 - 2.2.5。

例如，

pip install bmt-lite-1.8.2

使用方法

使用bmt-lite的方式几乎与使用bmt本身相同： https://github.com/biolink/biolink-model-toolkit#usage

开发

构建

pip install -rrequirements-build.txt
./build.sh

测试

pip install -rrequirements-test.txt
tox

发布

pip install twine
twine upload dist/*