生物链接模型工具包 - 轻量版！

bmt-lite 是 bmt 部分功能的零依赖近克隆。它背后有一个预先填充的输入/输出对缓存，用于许多常用的 bmt 方法。

bmt 本身占用约 127 KB 的磁盘空间，但包括所有依赖项在内，占用约 36.2 MB。另一方面，bmt-lite-1.8.2 在磁盘上约为 295 KB，其中约 254 KB 是缓存数据。从 bmt 初始化工具包需要约 2 秒，而从 bmt-lite 初始化工具包需要约 2e-7 秒。由于 bmt-lite 的所有行为都是预先缓存的，因此它不需要在运行时连接到互联网。

* 所有测量均在典型的笔记本电脑上，在随机周二下午进行

注意：bmt-lite 没有实现 bmt 的所有功能。欢迎提出功能请求（或拉取请求？！）。此外，现有功能可能略有不同；例如，bmt-lite 的元素名称/ID格式转换在某些特殊情况下已知会有所不同。

安装

您必须安装与您想要的 Biolink 模型版本相对应的特定 "口味" 的 bmt-lite。目前有 1.7.0 - 2.2.5 版本可用。

例如，

pip install bmt-lite-1.8.2

用法

使用 bmt-lite 几乎与您使用 bmt 本身一样：https://github.com/biolink/biolink-model-toolkit#usage

开发

构建

pip install -rrequirements-build.txt
./build.sh

测试

pip install -rrequirements-test.txt
tox

发布

pip install twine
twine upload dist/*