生物链接模型工具包 - 精简版！

bmt-lite 是 bmt 子集的零依赖近似克隆，它由预填充的输入/输出对缓存支持许多常用的 bmt 方法。

bmt 本身占用 ~127 KB 磁盘空间，但加上所有依赖项，占用 ~36.2 MB。另一方面，bmt-lite-1.8.2 在磁盘上占用 ~295 KB，其中 ~254 KB 是缓存数据。从 bmt 初始化工具包需要 ~2 秒，而从 bmt-lite 初始化工具包需要 ~2e-7 秒。因为 bmt-lite 的所有行为都是预先缓存的，所以在运行时不需要互联网。

* 所有测量均在一台典型笔记本电脑上随机星期二下午进行

注意： bmt-lite 并没有实现 bmt 的所有功能。欢迎提出功能请求（或拉取请求？！）。此外，现有功能可能略有不同；例如，bmt-lite 的元素名称/ID格式转换在某些特殊情况下已知与 bmt 不同。

安装

您必须安装与您想要的生物链模型版本相对应的特定“版本”的bmt-lite。目前可用的版本为1.7.0 - 2.2.5。

例如：

pip install bmt-lite-1.8.2

用法

几乎与使用bmt本身一样使用bmt-lite：[https://github.com/biolink/biolink-model-toolkit#usage](https://github.com/biolink/biolink-model-toolkit#usage)

开发

构建

pip install -rrequirements-build.txt
./build.sh

测试

pip install -rrequirements-test.txt
tox

发布

pip install twine
twine upload dist/*