生物链模型工具包 - 轻量版！

bmt-lite 是bmt的子集的零依赖近似克隆。它由许多常用bmt方法的输入/输出对的预填充缓存支持。

bmt本身在磁盘上占用约127 KB，但与其所有依赖项一起，它占用约36.2 MB。另一方面，bmt-lite-1.8.2在磁盘上占用约295 KB，其中约254 KB是缓存数据。从bmt初始化工具包需要约2秒，而从bmt-lite初始化工具包需要约2e-7秒。因为bmt-lite的所有行为都是预缓存的，所以它不需要在运行时联网。

所有测量均在一个典型的笔记本电脑上在随机的周二下午进行

注意：bmt-lite 并未实现 bmt 的所有功能。欢迎提出功能请求（或拉取请求？！）。此外，现有功能可能略有不同；例如，bmt-lite 的元素名/ID 格式转换在一些特殊情况下已知会有所不同。

安装

您必须安装与您希望使用的 Biolink 模型版本相对应的特定“版本”的 bmt-lite。目前可用版本为 1.7.0 - 2.2.5。

例如，

pip install bmt-lite-1.8.2

用法

使用 bmt-lite 的方式几乎与使用 bmt 本身相同：[https://github.com/biolink/biolink-model-toolkit#usage](https://github.com/biolink/biolink-model-toolkit#usage)

开发

构建

pip install -rrequirements-build.txt
./build.sh

测试

pip install -rrequirements-test.txt
tox

发布

pip install twine
twine upload dist/*