生物链接模型工具包 - 精简版！

bmt-lite 是bmt子集的零依赖近克隆。它支持许多常用bmt方法的输入/输出对的预填充缓存。

bmt单独占用约127 KB的磁盘空间，但包括所有依赖项在内，占用约36.2 MB。另一方面，bmt-lite-1.8.2在磁盘上占用约295 KB，其中约254 KB是缓存数据。从bmt初始化工具包需要约2秒，而从bmt-lite初始化工具包需要约2e-7秒。因为bmt-lite的所有行为都是预先缓存的，所以运行时不需要互联网。

* 所有测量都是在典型笔记本电脑上在某个星期二的下午进行的

注意：bmt-lite没有实现bmt的所有功能。欢迎提出功能请求（或拉取请求？！）。此外，现有功能可能略有不同；例如，bmt-lite的元素名称/ID格式转换对于某些特殊情况已知是不同的。

安装

您必须安装与您想要的Biolink模型版本相对应的特定“版本”的bmt-lite。当前可用的版本为1.7.0 - 2.2.5。

例如，

pip install bmt-lite-1.8.2

用法

使用bmt-lite的方式几乎与使用bmt本身完全相同：[https://github.com/biolink/biolink-model-toolkit#usage](https://github.com/biolink/biolink-model-toolkit#usage)

开发

构建

pip install -rrequirements-build.txt
./build.sh

测试

pip install -rrequirements-test.txt
tox

发布

pip install twine
twine upload dist/*