blendpdb 0.1.2

blendpdb
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blendpdb是一个用于混合两种不同物质以创建溶剂（如50%乙醇）的工具。
。

安装
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使用pip或easy_install，如下所示：

pip install blendpdb

用法
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用法：blendpdb SUB_A SUB_B 百分比 [选项]

混合SUB_B的百分比（体积比）与SUB_A

选项
-h, --help 显示此帮助信息并退出
-c FILE, --config=FILE
从文件加载配置（默认为'.blendrc'）
-v, --verbose 打印信息
-n, --dry 不创建混合PDB（'-v'将自动设置）
-o FILE, --output=FILE
将混合PDB输出到文件（默认为
<PERCENTAGE>p_<SUB_B>.pdb）
。

`blendrc`
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要添加不同的物质，在工作目录中创建`blendrc`文件，如下所示：

WAT: # 名称
longname: Water # 长名称
density: 1 # 密度 (g/cm^3)
molecular_weight: 18.01 # 分子量 (g/mol)
pdb: water.pdb # 指示物质的PDB文件
TFE: # 名称
longname: 2,2,2-Trifluoroethanol # 长名称
density: 1.393 # 密度 (g/cm^3)
molecular_weight: 100.04 # 分子量 (g/mol)
pdb: tfe.pdb # 指示物质的PDB文件

blendpdb还会尝试从您的家目录中加载`.blendrc`文件。