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各种简单的生物信息学工具和查找表

项目描述

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bioutils为生物信息学提供了一些常用工具和查找表。

  • bioutils.accessions – 解析访问号,推断命名空间

  • bioutils.assemblies – 人类组装信息(来自NCBI/GRCh)

  • bioutils.cytobands – 将染色体带映射到坐标(来自UCSC染色体带表)

  • bioutils.digests – 实现各种摘要

  • bioutils.normalize – 等位基因归一化(左移位,右移位,扩展,vcf)

要使用E-Utilities API密钥,请将其添加到名为ncbi_api_key的环境变量中,并在E-Utilities请求中使用它。

项目详情


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源代码发行版

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构建发行版

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上传时间 Python 3

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