BioMAJ核心库
项目描述
Biomaj
Biomaj核心库
属性可以通过模式BIOMAJ_X_Y_Z被环境变量覆盖,用于属性x.y.z
示例
使用BIOMAJ_LDAP_HOST替代ldap.host
3.0.28:使用pytest替代nose(已弃用),仅支持python3
3.0.27:添加.tgz扩展名支持
3.0.26:检查use_ldap和use_elastic作为布尔值(true/false或0/1)
3.0.25:utils/get_folder_size:如果文件未找到,捕获错误并继续
3.0.24: get_more_recent_file,返回文件信息
3.0.23: PR #9 添加下载的ssh默认值
3.0.21 [3.0.22 ,tag issue]: 锁定elasticsearch依赖项,v7破坏了一些API调用
3.0.20: PR #7 来自 institut-de-genomique/retry_method,重命名retryer的默认值。将wait_condition重命名为wait_policy在默认值中,从institut-de-genomique/retry_method添加retryer的默认值。为retryer添加默认值(参见相应的biomaj-download分支)。
3.0.19: 添加ftps和directftps协议 #4 强化硬链接复制 copy_files_with_regexp: 删除重复项 添加utils函数 代码清理
3.0.18: 允许在copy_files和copy_files_with_regexp中使用硬链接
3.0.17: 修复--log选项
3.0.16: 添加一些警告,如果某些文件丢失
3.0.15: 修复当参数为空或未定义时对bank properties配置文件的检查
3.0.14: 修复config.yml中的local_endpoint_XXX的检查 在rabbitmq未定义在config.yml中添加一个空字典
3.0.13: 添加归档完整性检查
3.0.12: 添加irods支持
3.0.11: 添加get_module_version静态方法,检查模块版本和pypi上的最新版本 允许进程的.args为空
3.0.10: 添加环境变量WEB_LOCAL_ENDPOINT_XX,其中XX为服务(在utils.py的Utils.services中定义),以定义每个服务的端点
3.0.9: #1 添加对bank properties的检查
3.0.8: 在覆盖中添加DOCKER_URL,MONGO_URL,MONGO_DB环境变量 不要在创建elasticsearch索引时失败,只需记录即可 添加rsync检查
3.0.7: 仅在必要时设置日志记录
3.0.6: 修复python 2与3的configparser导入问题
3.0.5: 添加环境变量覆盖配置
3.0.4: 代码清理
3.0.3: 将索引管理放入核心
3.0.2: 添加缺失的依赖项
3.0.1: 添加README等文件
3.0.0: biomaj和biomaj_core的分离
项目详情
下载文件
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源分布
构建分布
biomaj_core-3.0.28-py2.py3-none-any.whl的哈希
算法 | 哈希摘要 | |
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SHA256 | f49273c225b5f77b71bed4fe5f543ff2eae4aa1f023859eb6422ed548bf0c0e0 |
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MD5 | dc9a0474b08a03834d799f2d9ae54ea8 |
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BLAKE2b-256 | 9bc833b23379f43e0e8b190c1484981f7e02da3838ba272ad711c8a9bbff3ad6 |