一个用于读取分块OME TIFF图像的BioIO读取器插件。
项目描述
bioio-ome-tiled-tiff
使用bfio
读取分块OME TIFF文件的BioIO读取器插件。
文档
请查看我们GitHub页面上的完整文档 - 那里的通用使用和安装说明也适用于此包。
有关此包依赖的基本读取器的信息可以在bioio-base
仓库 此处 找到。
安装
稳定版本: pip install bioio-ome-tiled-tiff
开发头部: pip install git+https://github.com/bioio-devs/bioio-ome-tiled-tiff.git
示例用法(请参阅完整文档以获取更多示例)
与bioio一起安装bioio-ome-tiled-tiff
pip install bioio bioio-ome-tiled-tiff
此示例展示了如何通过显式将此Reader
传递到BioImage
中,仅通过访问图像的像素数据来使用它。将Reader
传递到BioImage
实例是可选的,因为bioio
将自动检测已安装的插件并自动选择支持传递文件的最新插件。
from bioio import BioImage
import bioio_ome_tiled_tiff
img = BioImage("my_file.ome.tiff", reader=bioio_ome_tiff.Reader)
img.data
问题
单击此处一次查看bioio-devs组织中的所有开放问题 或检查此存储库的问题选项卡。
开发
有关开发代码的信息,请参阅CONTRIBUTING.md。
项目详情
下载文件
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源代码发行版
bioio-ome-tiled-tiff-1.0.0.tar.gz (19.8 kB 查看哈希值)
构建发行版
关闭
bioio-ome-tiled-tiff-1.0.0.tar.gz 的哈希值
算法 | 哈希摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | e88429f281b8ee62aec75e15cfce6259471f235bed470315fa2604d5d5dae22c |
|
MD5 | b7ae57e849edcb48bb6f60eede481d78 |
|
BLAKE2b-256 | 6904536357ec73c0ac6073564f9bf92ff03b578ee21490e3b97d1126986b09d1 |
关闭
bioio_ome_tiled_tiff-1.0.0-py3-none-any.whl 的哈希值
算法 | 哈希摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | d32ab177361a00569efe232bc04add65bac1ea792029edc318767bb1d3f56033 |
|
MD5 | 9486203f31954119be34c414b9bb06d1 |
|
BLAKE2b-256 | 88447f15ddbf9c57b5097cda27cb816843308fede8e183eea2d02659d2b5dd71 |