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一个用于读取分块OME TIFF图像的BioIO读取器插件。

项目描述

bioio-ome-tiled-tiff

Build Status PyPI version License Python 3.9+

使用bfio读取分块OME TIFF文件的BioIO读取器插件。


文档

请查看我们GitHub页面上的完整文档 - 那里的通用使用和安装说明也适用于此包。

有关此包依赖的基本读取器的信息可以在bioio-base仓库 此处 找到。

安装

稳定版本: pip install bioio-ome-tiled-tiff
开发头部: pip install git+https://github.com/bioio-devs/bioio-ome-tiled-tiff.git

示例用法(请参阅完整文档以获取更多示例)

与bioio一起安装bioio-ome-tiled-tiff

pip install bioio bioio-ome-tiled-tiff

此示例展示了如何通过显式将此Reader传递到BioImage中,仅通过访问图像的像素数据来使用它。将Reader传递到BioImage实例是可选的,因为bioio将自动检测已安装的插件并自动选择支持传递文件的最新插件。

from bioio import BioImage
import bioio_ome_tiled_tiff

img = BioImage("my_file.ome.tiff", reader=bioio_ome_tiff.Reader)
img.data

问题

单击此处一次查看bioio-devs组织中的所有开放问题 或检查此存储库的问题选项卡。

开发

有关开发代码的信息,请参阅CONTRIBUTING.md

项目详情


下载文件

下载适用于您平台的文件。如果您不确定选择哪个,请了解有关安装包的更多信息。

源代码发行版

bioio-ome-tiled-tiff-1.0.0.tar.gz (19.8 kB 查看哈希值)

上传时间 源代码

构建发行版

bioio_ome_tiled_tiff-1.0.0-py3-none-any.whl (14.1 kB 查看哈希值)

上传时间 Python 3

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