bioio-ome-tiff

一个使用tifffile读取OME TIFF文件的BioIO读取器插件。

文档

在我们的GitHub页面站点上查看完整文档 - 其中包含的通用使用和安装说明将适用于此软件包。

有关此软件包所依赖的基本读取器的信息可以在bioio-base仓库中找到 此处

安装

稳定版本： pip install bioio-ome-tiff
开发头： pip install git+https://github.com/bioio-devs/bioio-ome-tiff.git

示例用法（请参阅完整文档以获取更多示例）

与bioio一起安装bioio-ome-tiff

pip install bioio bioio-ome-tiff

此示例显示了一个简单用例，通过显式将此Reader传递给BioImage来访问图像的像素数据。将Reader传递给BioImage实例是可选的，因为bioio将自动检测已安装的插件并自动选择支持传入文件的最新安装插件。

from bioio import BioImage
import bioio_ome_tiff

img = BioImage("my_file.ome.tiff", reader=bioio_ome_tiff.Reader)
img.data

问题

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开发

有关开发代码的信息，请参阅CONTRIBUTING.md。