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用于读取ND2图像的BioIO读取器插件。

项目描述

bioio-nd2

Build Status PyPI version License Python 3.9+

一个使用nd2读取nd2(尼康显微镜)文件的BioIO读取器插件。


文档

在我们的GitHub页面网站上查看完整文档 - 那里的通用使用和安装说明也适用于此包。

有关此包依赖的基础读取器的信息可以在bioio-base仓库中找到 此处

安装

稳定版本: pip install bioio-nd2
开发头: pip install git+https://github.com/bioio-devs/bioio-nd2.git

示例用法(请参阅完整文档以获取更多示例)

与bioio一起安装bioio-nd2

pip install bioio bioio-nd2

此示例展示了通过显式将此Reader传递到BioImage中,仅通过访问图像的像素数据的一个简单用例。将Reader传递到BioImage实例是可选的,因为bioio将自动检测已安装的插件并自动选择支持传入文件的最新插件。

from bioio import BioImage
import bioio_nd2

img = BioImage("my_file.nd2", reader=bioio_nd2.Reader)
img.data

问题

单击此处一次性查看bioio-devs组织中的所有开放问题或检查此存储库的问题标签。

开发

请参阅CONTRIBUTING.md以获取有关开发代码的信息。

项目详情


下载文件

下载适合您平台的文件。如果您不确定选择哪个,请了解更多关于安装包的信息。

源分布

bioio-nd2-1.0.0.tar.gz (18.2 kB 查看哈希值)

上传时间

构建分布

bioio_nd2-1.0.0-py3-none-any.whl (11.9 kB 查看哈希值)

上传时间 Python 3

支持者