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一个用于读取LIF(Leica Image File)图像的BioIO读取插件。

项目描述

bioio-lif

Build Status PyPI version License: GPL v3 Python 3.9+

一个用于使用readlif读取LIF(Leica)图像的BioIO读取插件。


文档

查看GitHub页面上的完整文档 - 里面的通用使用和安装说明适用于此包。

有关此包依赖的基本读取器的信息可以在bioio-base存储库中找到 此处

安装

稳定版本: pip install bioio-lif
开发头部: pip install git+https://github.com/bioio-devs/bioio-lif.git

示例用法(请参阅完整文档以获取更多示例)

与bioio一起安装bioio-lif

pip install bioio bioio-lif

此示例显示了通过显式将此Reader传递给BioImage来仅访问图像像素数据的一个简单用例。将Reader传递给BioImage实例是可选的,因为bioio将自动检测已安装的插件并自动选择支持传入文件的最新插件。

from bioio import BioImage
import bioio_lif

img = BioImage("my_file.lif", reader=bioio_lif.Reader)
img.data

问题

单击此处一次性查看bioio-devs组织中的所有开放问题或检查此存储库的问题标签。

开发

有关开发代码的信息,请参阅CONTRIBUTING.md

项目详情


下载文件

下载适用于您的平台的文件。如果您不确定选择哪个,请了解更多关于安装包的信息。

源分发

bioio-lif-1.0.0.tar.gz (36.6 kB 查看散列值)

上传时间

构建分发

bioio_lif-1.0.0-py3-none-any.whl (30.1 kB 查看散列值)

上传时间 Python 3

支持