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用于读取czi图像的Bioio读取器插件。

项目描述

bioio-czi

Build Status PyPI version License: GPL v3 Python 3.9+

使用 aicspylibczi 读取CZIs的BioIO读取器插件


文档

在GitHub页面网站上查看完整文档 - 里面的一般用途和安装说明适用于此包。

有关此包所依赖的基读取器的信息可以在 bioio-base 存储库 此处 找到

安装

稳定版本: pip install bioio-czi
开发头部: pip install git+https://github.com/bioio-devs/bioio-czi.git

示例用法(请参阅完整文档以获取更多示例)

与bioio一起安装bioio-czi

pip install bioio bioio-czi

此示例显示了一个简单的用例,通过显式将此 Reader 传递到 BioImage 中来访问图像的像素数据。将 Reader 传递到 BioImage 实例是可选的,因为 bioio 将自动检测已安装的插件并自动选择支持传入文件的最新已安装插件。

from bioio import BioImage
import bioio_czi

img = BioImage("my_file.czi", reader=bioio_czi.Reader)
img.data

问题

单击此处一次查看bioio-devs组织中的所有开放问题 或检查此存储库的问题标签页。

开发

请参阅 CONTRIBUTING.md 了解有关代码开发的相关信息。

项目详情


下载文件

下载适用于您平台的文件。如果您不确定选择哪个,请了解有关 安装包 的更多信息。

源分布

bioio_czi-1.0.1.tar.gz (350.0 kB 查看哈希值)

上传时间

构建分布

bioio_czi-1.0.1-py3-none-any.whl (370.6 kB 查看哈希值)

上传时间 Python 3

由...