一个易于将数据和元数据代理到存储库的软件包。
项目描述
Biobroker
此仓库包含Biobroker Python软件包的源代码。此软件包包含多个实用工具,但其总体哲学/目标是
给定任何类型包含实体元数据的输入文件,将其代理到任何存档并返回可读结果。
我明白这是一个非常雄心勃勃的项目;首先,现有存档的种类太多了。目前,此软件包正在扩展我对EMBL-EBI托管欧洲基因组学/生物存档的知识基础上进行开发。可能有些存档不能直接适应,但如果这个库可以扩展到仅与足够的存档一起工作,以确保生物学实验室可以设置一个适用于他们的自动代理过程,我将非常高兴。
安装
pip3 install biobroker
用法
该库目前不支持CLI访问(将来可能会考虑CLI;尽管我更愿意有一个简单的GUI)。因此,您将不得不使用提供的对象安装和编写脚本。
有关用法,请参阅存储库中的examples/文件夹。
有关总体基础设施和每个类的详细文档,请参阅ReadTheDocs页面
项目详情
下载文件
下载适合您平台的文件。如果您不确定选择哪个,请了解更多关于安装包的信息。
源分发
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构建分发
biobroker-0.0.4-py3-none-any.whl (55.1 kB 查看哈希值)
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biobroker-0.0.4.tar.gz的哈希值
算法 | 哈希摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | e8920a99439c85680eec8235230a4463def5ee15aee5078c17341c0f3cdff291 |
|
MD5 | e9b7f06eb52e09d2a09ff65b33ff3453 |
|
BLAKE2b-256 | 8e18b4f4a680c33392a72942da9e7d7207b08afe7a2b813a518b79de7bc1ae35 |
关闭
biobroker-0.0.4-py3-none-any.whl的哈希值
算法 | 哈希摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | 0b72808c04c23a8438bb9c003f02b3cc41cf209d36c382d40ec31fcf09197f71 |
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MD5 | 67c6c15887beb635888dd1a252bcc530 |
|
BLAKE2b-256 | 405efedd773ca4aa91a78fd21ca3196eebcf17c38860628195ad14b53554f397 |