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一个易于将数据和元数据代理到存储库的软件包。

项目描述

Biobroker

此仓库包含Biobroker Python软件包的源代码。此软件包包含多个实用工具,但其总体哲学/目标是

给定任何类型包含实体元数据的输入文件,将其代理到任何存档并返回可读结果。

我明白这是一个非常雄心勃勃的项目;首先,现有存档的种类太多了。目前,此软件包正在扩展我对EMBL-EBI托管欧洲基因组学/生物存档的知识基础上进行开发。可能有些存档不能直接适应,但如果这个库可以扩展到仅与足够的存档一起工作,以确保生物学实验室可以设置一个适用于他们的自动代理过程,我将非常高兴。

安装

pip3 install biobroker

用法

该库目前不支持CLI访问(将来可能会考虑CLI;尽管我更愿意有一个简单的GUI)。因此,您将不得不使用提供的对象安装和编写脚本。

有关用法,请参阅存储库中的examples/文件夹。

有关总体基础设施和每个类的详细文档,请参阅ReadTheDocs页面

项目详情


下载文件

下载适合您平台的文件。如果您不确定选择哪个,请了解更多关于安装包的信息。

源分发

biobroker-0.0.4.tar.gz (55.5 kB 查看哈希值)

上传时间

构建分发

biobroker-0.0.4-py3-none-any.whl (55.1 kB 查看哈希值)

上传时间 Python 3

由以下支持