将miRTarBase转换为BEL的软件包
项目描述
将文本挖掘的miRNA靶标相互作用序列化到BEL
安装 
bio2bel_mirtarbase 可以通过在您喜欢的终端中输入以下代码轻松从PyPI安装
$ python3 -m pip install bio2bel_mirtarbase或从GitHub的最新代码中安装
$ python3 -m pip install git+https://github.com/bio2bel/mirtarbase.git@master设置
miRTarBase可以从Python REPL或自动安装的命令行实用程序中下载和填充。
Python REPL
>>> import bio2bel_mirtarbase
>>> mirtarbase_manager = bio2bel_mirtarbase.Manager()
>>> mirtarbase_manager.populate()命令行实用程序
bio2bel_mirtarbase populate引用
Chih-Hung Chou等; miRTarBase 2016：对实验验证的miRNA靶标相互作用数据库的更新。Nucleic Acids Res 2016; 44 (D1): D239-D247. doi: 10.1093/nar/gkv1258
链接
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源代码发行版
bio2bel_mirtarbase-0.2.2.tar.gz (27.3 kB 查看哈希值)
构建发行版
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bio2bel_mirtarbase-0.2.2.tar.gz的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | d3b11a6c18bc6aa028cb2d3df9d87d6bf2122168f207505b7816f846d760bda6 |
|
| MD5 | 1cfb668f9ce529c32db69092d5e535a4 |
|
| BLAKE2b-256 | fb379eab517fdb88b96be1fe8c9159483ab2bad243fbddbb6283563f591fa8e7 |
关闭
bio2bel_mirtarbase-0.2.2-py3-none-any.whl的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 5490e44b2244eb906392edff9a5833095103599ce4473cefb49fc44891bc8654 |
|
| MD5 | 285f63bad0021ddfc762dc655756c3b7 |
|
| BLAKE2b-256 | 214f5009b8801c8882f2ad98ab5cabc246adb9e1e244894bcd77899266132279 |
