将InterPro转换为BEL的软件包
项目描述
将InterPro蛋白质家族、域和其他类别转换为BEL的本体关系。
安装 
bio2bel_interpro 可以通过以下代码在您喜欢的终端中轻松安装从PyPI
$ python3 -m pip install bio2bel_interpro或者从GitHub的最新代码中安装
$ python3 -m pip install git+https://github.com/bio2bel/interpro.git@master设置
可以从Python交互式解释器或自动安装的命令行工具中下载和填充InterPro。
Python交互式解释器
>>> import bio2bel_interpro
>>> interpro_manager = bio2bel_interpro.Manager()
>>> interpro_manager.populate()命令行工具
bio2bel_interpro populate程序化接口
要丰富BEL图中的蛋白质及其InterPro条目（家族、域、位点等），请使用
>>> from bio2bel_interpro import enrich_proteins >>> graph = ... # get a BEL graph >>> enrich_proteins(graph)
下载文件
下载您平台对应的文件。如果您不确定该选择哪个，请了解更多关于安装包的信息。
源分布
bio2bel_interpro-0.2.1.tar.gz (19.4 kB 查看哈希值)
构建分布
bio2bel_interpro-0.2.1-py3-none-any.whl (15.4 kB 查看哈希值)
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bio2bel_interpro-0.2.1.tar.gz的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | cc5ed527465dbcb99cbd3d2f46b8c5d8c1c7cf2a93c5501bc12248fa3357ae5b |
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| MD5 | fb8d5bb8eff9bb942dea9f1cf99ce943 |
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| BLAKE2b-256 | a40a2d4da914f1411943706fea07d76131750e0c6e79cdd5bccdaca8315f4710 |
关闭
bio2bel_interpro-0.2.1-py3-none-any.whl的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 5bcf1d44132b5509a42eed20ec5fe01833ff28c2166a509809223304db50f90e |
|
| MD5 | ba06644f3efd3c47a474233ecce49b1c |
|
| BLAKE2b-256 | f6222c97079426b314bf950916ad2cf48b66630736e34d90eb76c75b97929de4 |