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将HGNC转换为BEL的软件包

项目描述

此软件包创建

  • HGNC BEL命名空间

  • HGNC基因家族BEL命名空间,

  • HGNC基因家族成员BEL脚本

  • 同源BEL脚本

安装 PyPI上的当前版本 稳定支持的Python版本 MIT许可证

bio2bel_hgnc 可以通过在您喜欢的终端中运行以下代码轻松从 PyPI 安装

$ python3 -m pip install bio2bel_hgnc

或从GitHub上的最新代码获取

$ python3 -m pip install git+https://github.com/bio2bel/hgnc.git@master

设置

HGNC 可以通过 Python REPL 或自动安装的命令行工具下载并填充。

Python REPL

>>> import bio2bel_hgnc
>>> hgnc_manager = bio2bel_hgnc.Manager()
>>> hgnc_manager.populate()

命令行工具

bio2bel_hgnc populate

引用

致谢

  • 本软件包高度依赖于 Andrej Konotopez 的软件包 PyHGNC

支持者

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