用于解析和存储Entrez Gene数据库的软件包
项目描述
此软件包下载、解析和存储Entrez Gene和HomoloGene数据库，并提供将数据转换为BEL的实用工具。
安装 
bio2bel_entrez 可以轻松地从 PyPI 安装，在您喜欢的终端中输入以下代码
$ python3 -m pip install bio2bel_entrez或从 GitHub 上的最新代码安装
$ python3 -m pip install git+https://github.com/bio2bel/entrez.git@master设置
Entrez可以从Python REPL或自动安装的命令行实用工具下载和填充。
Python REPL
>>> import bio2bel_entrez
>>> entrez_manager = bio2bel_entrez.Manager()
>>> entrez_manager.populate()命令行实用工具
bio2bel_entrez populate引用
Maglott, D., et al. (2011). Entrez Gene: gene-centered information at NCBI. Nucleic Acids Research, 39(Database issue), D52–D57.
下载文件
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源分发
bio2bel_entrez-0.2.2.tar.gz (18.9 kB 查看哈希值)
构建分发
bio2bel_entrez-0.2.2-py3-none-any.whl (15.5 kB 查看哈希值)
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bio2bel_entrez-0.2.2.tar.gz 的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | fc1f7a95cf879b238d7036619c59cdc9462a748287e200cc86d41fdc7e650f2e |
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| MD5 | 0dd600ba42607c9b1a5348da0290d753 |
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| BLAKE2b-256 | b6bca2d451d35df1212456673c1917f4a9aa1600cd34ffe955265a0ed6d8b28f |
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bio2bel_entrez-0.2.2-py3-none-any.whl 的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 20c36e7804c6b98f79fedf51ddaf207899148bfd4de31ea82fc1eee9ad4829ea |
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| MD5 | 5ab1f5fc04d2beaf399d07b4c0ac529f |
|
| BLAKE2b-256 | c4f0be84fdf4e85aed343fd0920ff332527617b1e6421ac00601901a985ca57b |